畸形股權結構，分三種情形，做不同處理。
1. 第一種情形：股權結構畸形，但是未顯現出危害。措施：繼續保持，未雨綢繆，逐漸優化。
2. 第二種情形：股權結構畸形，矛盾已經顯現，但尚可協商。措施：通過良性協商，改變股權結構，或者優化公司治理，緩解畸形股權危害。 （1）通過內部股權轉讓改變股權結構。 （2）增資擴股，引入外部投資者，改變股權結構和治理態勢。 （3）通過與別的公司合并，產生新的公司，謀求良性發展。 （4）作為權宜之計，通過股東控制權放棄，解決決策困難的問題。
例如，平衡股權，其中一個股東放棄控制權，退出經營管理，承擔經營管理責任的一方，領取動態薪酬。當然，作為平衡，可以確立分紅優先權，并落實股東知情權、監督權和某些事項的否決權。
（5）通過強有力的董事會解決決策問題。
例如，平均分散股權，股東開會困難，且經常議而不決。在這種情況下，組建強有力的董事會，把多數決策權放到董事會，問題得到解決。
（6）通過管理層激勵解決經營積極性問題。
例如，平均分散股權，誰都管，誰都不管。在這種情況下，選舉或聘任管理者，加強激勵，讓他們為薪酬而不只是為股權而戰，增強積極性。如果引入股權激勵，就不單是能夠解決積極性問題，還能不斷優化股權結構——讓干活的、有貢獻的越來越增持股權，而其他股東也不吃虧。
3. 第三種情形：股權結構畸形，矛盾激化，無法良性協商。措施：還是要協商，做手術，盡量把損失降到最低。
（1）通過公司分立，在不關門的情況下，各自謀求發展。
（2）解散公司，各奔東西。不能相濡以沫，便相忘于江湖。
唯一不能做的，就是法庭內外，互相傷害，互相傾軋，乃至大打出手，頭破血流，甚至動用黑白兩道，你死我活，做殊死之爭。
